J.P. Euzéby : Abrégé de Bactériologie Générale et Médicale à l'usage des étudiants de l'Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse
 

Bactériologie Générale
Bactériologie Médicale

Autres sites Web : List of Prokaryotic Names with Standing in Nomenclature - Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire - SBSV
 

Annexe 1 : Principaux bactériophages

Les données présentées ci-dessous ont été établies à partir du site The Universal Virus Database of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTVdB). Le lecteur souhaitant obtenir des information complémentaires sur les bactériophages (morphologie, structure, photographies, ...) est invité à consulter le site ICTVdb et notamment le fichier ICTVdb Index of Viruses.

Notes:
. De nombreux phages ne sont pas répertoriés dans la base de données de l'ICTV. Parmi eux, on peut citer les phages utilisés pour l'identification des souches de Brucella (à l'exception du Brucella phage Tb), les phages ε15 et ε34 des salmonelles, les phages codant pour les toxines Stx (Siga-like toxins), etc.
. L'ICTV écrit en italiques les noms officiellement acceptés et ce comité préconise l'usage des caractères romains pour les noms des bactériophages non officiellement acceptés, les noms des sous-espèces, les noms des sérovars, ... Dans le document présenté ci-dessous et dans le fichier "Bactériophages, transduction et conversion lysogénique", ces recommandations seront respectées.

Phages à ADN bicaténaire, non enveloppés

Ordre des Caudovirales : phages à symétrie binaire, infectant les bactéries du domaine des Bacteria et du domaine des Archaea.

    Famille des Myoviridae : phages à queue longue et contractile, infectant les bactéries du domaine des Bacteria et du domaine des Archaea.

        Genre "T4-like viruses" (espèce type : Enterobacteria phage T4). Principaux hôtes: Acinetobacter spp., Aeromonas spp., entérobacteries, Pseudomonas spp., Vibrio spp.

        Genre "P1-like viruses" (espèce type : Enterobacteria phage P1). Principaux hôtes: Aeromonas spp., Acetobacter spp., entérobacteries, Pseudomonas spp., Vibrio spp.

        Genre "P2-like viruses" (espèce type : Enterobacteria phage P2). Principaux hôtes: Aeromonas spp., entérobactéries, Haemophilus spp., Pasteurella spp., Pseudomonas spp., Rhizobium spp.

        Genre "Mu-like viruses" (espèce type : Enterobacteria phage Mu). Principaux hôtes: entérobactéries, Pseudomonas spp., Vibrio spp.

        Genre "SPO1-like viruses" (espèce type : Bacillus phage SP01). Principaux hôtes : Bacillus spp., Lactobacillus spp.

        Genre "φH-like viruses" (espèce type : Halobacterium phage φH). Principaux hôtes: Halobacterium spp.

        Genre "PBS1-like viruses" (espèce type : Bacillus phage PBS1). Principaux hôtes : Bacillus spp.

        De nombreuses espèces sont non classées dans un genre et elles peuvent infecter les Acinetobacter spp., les Actinomyces spp., les Aeromonas spp., les Alcaligenes spp., les Bacillus spp., les espèces du phylum des Cyanobacteria, des bactéries corynéformes, les entérobacteries, les Lactobacillus spp., les Listeria spp., les Mycobacterium spp., les Pseudomonas spp., les Rhizobium spp., les Xanthomonas spp., les Vibrio spp.

    Famille des Siphoviridae : phages à queue longue et non contractile, infectant les bactéries du domaine des Bacteria et du domaine des Archaea.

        Genre "λ-like viruses" (espèce type : Enterobacteria phage λ). Principaux hôtes : entérobactéries, Rhizobium spp.

        Genre "T1-like viruses" (espèce type : Enterobacteria phage T1). Principaux hôtes : entérobactéries.

        Genre "T5-like viruses" (espèce type : Enterobacteria phage T5). Principaux hôtes : entérobactéries, Vibrio spp.

        Genre "L5-like viruses" (espèce type : Mycobacterium phage L5). Principaux hôtes : Mycobacterium spp.

        Genre "c2-like viruses" (espèce type : Lactococcus phage c2). Principaux hôtes : Lactococcus spp.

        Genre "ΨM1-like viruses" (espèce type : Methanobacterium phage ΨM1). Principaux hôtes : Methanobacterium spp., Methanobrevibacter spp.

        Genre "ΦC31-like viruses" (espèce type : Streptomyces bacteriophage φC31). Principaux hôtes : Streptomyces spp.

        Genre "N15-like viruses" (espèce type : Enterobacteria phage N15). Principaux hôtes : entérobactéries.

        De nombreuses espèces sont non classées dans un genre et elles peuvent infecter les Acinetobacter spp., les Actinomyces spp., les Agrobacterium spp., les Bacillus spp., les Burkholderia spp., les Clostridium spp., des bactéries corynéformes, les espèces du phylum des Cyanobacteries, les entérobactéries, les Lactobacillus spp., les Lactococcus spp., les Leuconostoc spp., les Listeria spp., les Micrococcus spp., les Mycobacterium spp., les Pasteurella spp., les Pseudomonas spp., les Rhizobium spp., les Staphylococcus spp., les Streptococcus spp., les Vibrio spp.

    Famille des Podoviridae : phages à queue courte et non contractile, infectant les bactéries du domaine des Bacteria.

        Genre "T7-like viruses" (espèce type : Enterobacteria phage T7). Principaux hôtes : Caulobacter spp., entérobacteries, Pseudomonas spp., Rhizobium spp., Vibrio spp.

        Genre "φ29-like viruses" (espèce type : Bacillus phage φ29). Principaux hôtes : Bacillus spp., Kurthia spp. Staphylococcus spp., Streptococcus spp.

        Genre "P22-like viruses" (espèce type : Enterobacteria phage P22). Principaux hôtes : Aeromonas spp., Azotobacter spp., entérobactéries, Hyphomicrobium spp., Pseudomonas spp., Vibrio spp.

        Genre "N4-like viruses" (espèce type : Enterobacteria phage N4). Principaux hôtes : entérobactéries.

        De nombreuses espèces sont non classées dans un genre et elles peuvent infecter les Acinetobacter spp., les Bacillus spp., les Brucella spp., les Clostridium spp., des bactéries corynéformes, les espèces du phylum des Cyanobacteria, les entérobactéries, les Lactococcus spp., les espèces de la classe des Mollicutes, les Mycobacterium spp., les Pasteurella spp., les Pseudomonas spp., les Rhizobium spp., les Roseobacter spp., les Streptococcus spp., les Synechococcus spp., les Vibrio spp., les Xanthomonas spp.

Familles non placées dans un ordre

    Famille des Corticoviridae : phages à symétrie cubique, infectant les bactéries du domaine des Bacteria.

        Genre Corticovirus (espèce type : Pseudoalteromonas phage PM2). Principaux hôtes : Alteromonas spp., Pseudoalteromonas spp.

    Famille des Rudiviridae : phages à ADN bicaténaire, non enveloppés, en forme de bâtonnets, infectant les bactéries du domaine des Archaea.

        Genre Rudivirus (espèce type : Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 2). Principaux hôtes : Sulfolobus spp.

    Familles des Tectiviridae : phages à symétrie cubique, infectant les bactéries du domaine des Bacteria.

        Genre Tectivirus (espèce type : Enterobacteria phage PRD1). Principaux hôtes : Bacillus spp., entérobacteries.

Phages à ADN bicaténaire enveloppés

Famille des Plasmaviridae : phages polymorphes, ne possédant pas de capside, constitués uniquement d'une enveloppe et d'une nucléoprotéine, infectant des bactéries de l'ordre des Mycoplasmatales.

     Genre Plasmavirus (espèce type : Acholeplasma phage L2). Principaux hôtes : Acholeplasma spp.

Famille des Guttaviridae : phages en forme de gouttelette, infectant les bactéries du domaine des Archaea.

     Genre Guttavirus (espèce type : Sulfolobus newzealandicus droplet-shaped virus). Principaux hôtes : Sulfolobus spp.

Famille des Fuselloviridae : phages en forme de citron, infectant les bactéries du domaine des Archaea.

     Genre Fusellovirus (espèce type : Sulfolobus spindle-shaped virus 1). Principaux hôtes : Sulfolobus spp.

Famille des Lipothrixviridae : phages filamenteux ou en forme de bâtonnets, infectant les bactéries du domaine des Archaea.

    Genre Alphalipothrixvirus (espèce type : Thermoproteus tenax virus 1). Principaux hôtes : Thermoproteus spp.

    Genre Betalipothrixvirus (espèce type: Sulfolobus islandicus filamentous virus). Principaux hôtes : Desulfurolobus spp., Sulfolobus spp., Thermoproteus spp.

    Genre Gammalipothrixvirus (espèce type : Acidianus filamentous virus 1). Principaux hôtes : Acidianus spp.

Genre non classé dans une famille

   Genre Salterprovirus (espèce type : His1 virus) : phages à en forme de citron, présentant des fibres attachées à un pôle dela particule virale, infectant les bactéries du domaine des Archaea. Principaux hôtes : Haloarcula spp.

Phages à ADN monocaténaire, non enveloppés

Famille des Inoviridae : phages filamenteux ou en forme de bâtonnets, à symétrie hélicoïdale, infectant les bactéries du domaine des Bacteria.

    Genre Inovirus (espèce type : Enterobacteria phage M13). Principaux hôtes : entérobacteries, Pseudomonas spp., Xanthomonas spp.

    Genre Plectrovirus (espèce type : Acholeplasma phage MV-L51). Principaux hôtes : Acholeplasma spp., Spiroplasma spp.

Famille des Microviridae : phages à symétrie cubique, possédant de grands capsomères, infectant les bactéries du domaine des Bacteria.

    Genre Microvirus (espèce type : Enterobacteria phage φX174). Principaux hôtes : entérobactéries.

    Genre Spiromicrovirus (espèce type : Spiroplasma phage 4). Principaux hôtes : Spiroplasma spp.

    Genre Bdellomicrovirus (espèce type : Bdellovibrio phage MAC 1). Principaux hôtes : Bdellovibrio spp.

    Genre Chlamydiamicrovirus (espèce type : Chlamydia phage 1). Principaux hôtes : Chlamydia spp., Chlamydophila spp.

Phages à ARN bicaténaire

Famille des Cystoviridae : phages enveloppés, sphériques, à génome fragmenté, infectant les bactéries du domaine des Bacteria.

    Genre Cystovirus (espèce type : Pseudomonas phage φ6). Principaux hôtes: Pseudomonas spp.

Phages à ARN monocaténaire

Famille des Leviviridae : phages à ARN monocaténaire de polarité positive, non enveloppés, sphériques, à symétrie cubique, infectant les bactéries du domaine des Bacteria.

    Genre Levivirus (espèce type : Enterobacteria phage MS2). Principaux hôtes : entérobactéries.

    Genre Allolevivirus (espèce type : Enterobacteria phage Qß). Principaux hôtes : entérobactéries.

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